摘要LLM 归库摘要

核心内容： 论文校样（Proof）阶段参考文献体系整理的标准流程，聚焦 EndNote：重复文献处理、Traveling Library 归位、批量补 DOI、DOI 反向验证与脏数据检查。

适用场景： 多人合作写稿后进入校样阶段，参考文献出现重复/缺 DOI/Traveling Library 混入等历史遗留问题。

输入： Word 文稿 + EndNote Library（.enlx 备份）；正文引用关系需先清理干净，再谈补 DOI。

输出： 干净统一的参考文献体系——无重复、无 Traveling Library、编号连续、字段完整、DOI 指向正确、无 DOI 的老文献保持为空。

关键步骤： ①备份（Word 复制 + Compressed Library）；②去重（选主记录→Remove Citation→重插→Update）；③Traveling Library 归位（Export Traveling Library 或 Remove 后重插）；④补 DOI（Find Reference Updates→Update Empty Fields；量大可用 AI 读 Crossref）；⑤DOI 反向验证（拿 DOI 查 Crossref 再比对标题）；⑥脏数据检查（Author/Title/Journal/Year/Volume/Issue/Pages/DOI）；⑦EndNote 重新生成 Reference List。

常见错误： 直接删文末 Reference List 条目（会被 EndNote 重新生成）；Update All Fields 覆盖已正确的作者/期刊格式；自动匹配到同名错误 DOI；为老文献硬找一个相似 DOI（错误 DOI 比没有更麻烦）。

与口腔生信连接： 投稿/返修阶段处理含大量引用的手稿（如综述、机制类文章）时，可用该流程避免参考文献被退修；EndNote 与 Zotero 之间的迁移思路可类比。

下一步处理： 暂未试用；建议下次手稿进入校样阶段时按本页清单核对。

归库说明： 分类到 02 文献精读与汇报库（methods 方法知识），置信度 0.75，理由：EndNote 参考文献整理属论文写作/文献管理方法，非单篇论文，AI 仅为辅助工具。

背景

论文进入校样（Proof）阶段，很多人第一反应是检查错别字和格式，但参考文献往往是最麻烦的部分。尤其经过多人修改后，容易出现：

同一篇文献被引用两次（EndNote 里两条不同记录）
大量文献没有 DOI
合作者插入的引用显示为 Traveling Library
作者、期刊、卷期页字段本身有误

本文整理自一篇实操经验：用 Word + EndNote + AI 科研工作台（Wisp Science）在几天内把 ~90 条参考文献体系重新整理干净。

标准处理流程（固定顺序）

第 0 步：先别急着补 DOI#

DOI 只是表面问题。第一步先确认 Word 里的引用关系是否干净。本次主要发现三类问题：

参考文献重复——同一篇文献在文末出现两次、对应不同编号。这是正文不同位置引用了 EndNote 里的两条不同记录，不能直接删文末其中一条，否则下次 EndNote 更新还会重新生成。
大量记录缺 DOI——有作者/题目/期刊/年份但 DOI 字段为空。几篇可人工查，几十篇逐条查询很低效。
多人协作产生 Traveling Library——EndNote → Edit & Manage Citation(s) 里部分文献显示自己的 Library，部分显示 Traveling Library。说明这些引用是合作者从他自己的库插入的，Record Number 已与你电脑上的库对不上。

第 1 步：动手之前先备份#

校样阶段最怕一顿操作后引用编号乱掉。先做两份备份：

Word 文稿：直接复制一份。
EndNote：File → Compressed Library 导出一个 .enlx 完整备份。

后面无论删除并重新插入 Citation，还是导出 Traveling Library，出问题都有回退空间。

第 2 步：重复文献不要直接删文末列表#

正确做法：

确定 EndNote 里哪条记录作为主记录（优先保留信息更完整、有 DOI、有附件、被更多位置引用的那条）。
回到正文，找到引用另一条 Record 的位置。
在 Word 中 EndNote → Edit & Manage Citation(s)，选中需替换的引用 → Remove Citation。
引用编号暂时消失是正常的。保持光标在原位置，用 Insert Citation 重新插入主记录。
执行 Update Citations and Bibliography。

EndNote 会自动合并重复文献并重排编号。

第 3 步：Traveling Library 怎么处理#

Traveling Library 本身不是错误（EndNote 为协作把引用信息嵌入 Word），但最终校样阶段最好统一回自己的本地库。

分两种情况：

自己的库没有这篇文章：EndNote → Export to EndNote → Export Traveling Library，选择当前使用的库，Word 携带的文献进入本地库。
自己的库已有这篇文章：不建议再次导入（易制造重复）。直接把正文里 Traveling Library 引用 Remove 掉，再从自己的库重新 Insert Citation 即可。例如合作者库里 Gong 2020 是 Record #2，你库里是 #113，就移除后重插。

处理完成后打开 Edit & Manage Citation(s) 从头检查：Library 一栏不应再出现 Traveling Library。

第 4 步：再批量补 DOI#

重复文献和 Traveling Library 处理完后再补 DOI：

只缺几篇：References → Find Reference Updates，优先选 Update Empty Fields（只填空字段）。Update All Fields 可能把已正确的作者、期刊缩写、页码格式覆盖掉。
一次缺几十篇：可让 AI（如 Wisp Science）读取参考文献列表，通过 Crossref 批量查询 DOI，再与 EndNote 记录对应。顺带能发现期刊名缺失、作者字段污染、卷期页不完整等记录本身的问题。

第 5 步：DOI 找到了，也不一定是对的#

自动检索找到的 DOI 格式正常、能打开，不代表就是正确的那篇。案例：标题只有一个词 Osteosarcoma，自动检索找到的 DOI 其实是同名的其他条目，不是引用的 Nature Reviews Disease Primers 综述。

批量补 DOI 不能只判断字段是否非空。标题短、标题通用、同名文章多的文献，自动匹配容易撞车。

第 6 步：最后一定要反向验证 DOI#

人工可随机打开一些 DOI 核对标题/一作/期刊/年份；文献多则做反向验证：拿 DOI 去 Crossref 查询，再把返回的论文标题与参考文献里的标题重新比较。

只有"标题查 DOI"和"DOI 反查论文"两边都能对应上，才算通过。这一步能发现前面的错误 DOI。

第 7 步：没有 DOI 不一定是错误#

部分较早的老期刊文章本身没有注册 DOI。保持 DOI 为空是正确的，不要为了 100% 覆盖率硬找一个相似的 DOI。错误 DOI 比没有 DOI 更麻烦。

第 8 步：顺手检查 EndNote 脏数据#

补 DOI 过程中常发现历史导入的异常记录，如作者名显示成 Meek, D.W.J.D.r.、文章只有年份卷期页但期刊名缺失。说明早期导入时字段解析出错。

校样阶段顺带检查这些字段：Author、Title、Journal、Year、Volume、Issue、Pages、DOI。特别是作者字段出现奇怪缩写、期刊名为空、格式突然与前后不一致的记录。

第 9 步：最终不要手改 Reference List#

所有数据修好后，再回 Word 执行 Update Citations and Bibliography，让 EndNote 重新生成整个参考文献列表。不要直接在文末手工删文献、改作者、填 DOI、改编号——下次 EndNote 更新会被覆盖。

真正该修的是 EndNote Library，不是 Word 里显示出来的 Reference List。

校样稿参考文献检查清单

最终至少确认几件事：

没有 Traveling Library
没有重复参考文献
编号连续
作者、期刊、年份、卷期页完整
应该有 DOI 的文献都有 DOI
DOI 确实指向正确论文
确认没有 DOI 的老文献保持为空

AI 辅助经验（Wisp Science）

这类高度结构化、需要大量检索和交叉核对的工作特别适合交给科研 Agent。Wisp Science（本地智能科研工作台）在此案例中做的事：

读取 Word 文稿
理解 EndNote Library
识别异常记录
批量检索 Crossref DOI
对结果做交叉验证（标题查 DOI + DOI 反查论文）

作为人类，需要在关键节点对 AI 做出更清晰的指令。可以依赖 AI 规划解决问题的路径，但是否真的达到目的，仍需自己留心检查。

与口腔生信/写作流程的连接

综述类稿件、机制类文章引用量大，返修阶段可用本流程避免"参考文献退修"。
EndNote 与 Zotero 的迁移、去重逻辑可类比（Zotero 同理建议在源库修正而非手改 Word）。
配合本库文献笔记的 DOI/PMID 字段，可在整理时统一核对。

原始出处

公众号：果子学生信 · 冻春卷《论文校样阶段，如何高效解决文献插入问题？》
原文链接：https://mp.weixin.qq.com/s/0J8UHhtiR-UE71qPB1deYw