RIOM （放射性口腔黏膜炎）公开数据汇总

搜索时间：2026-04-09　｜　搜索范围：GEO、NCBI SRA、ArrayExpress、CellxGene、PubMed

scRNA-seq 数据（唯一可用）

代谢支持可保护放射性黏膜炎中的黏膜免受铁死亡的影响 | 自然通讯 --- Metabolic support protects mucosa from ferroptosis in radiation-induced mucositis | Nature Communications

**优势：**目前公开数据库中唯一的 RIOM 单细胞数据集；清晰时间梯度；高细胞分辨率

二、Bulk 转录组 / 基因芯片数据

数据库编号	物种	样本类型	实验设计	分组	时间点	平台	样本数	下载入口	关联论文
GSE103412 地理信息系统访问记录查看器 --- GEO Accession viewer	人 (Homo sapiens)	口腔黏膜活检 + 外周血	8例扁桃体鳞癌患者 + 9名健康对照；放疗前→第5天→第21天连续取材	放疗组（3时间点）/ 健康对照组	3个时间点（基线、放疗期间、恢复期）	Affymetrix Human Exon 1.0 ST	64 samples	GEO	PMC5770028 journals.plos.org/plosone/article?id=10.1371/journal.pone.0190709
GSE150738 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi	人 (Homo sapiens)	3D非角化黏膜模型（MatTek）	对照 vs 5Gy照射 vs 右泛醇处理	对照 / 照射 / 药物干预 3组	单一时间点（照射后）	Affymetrix Clariom S Human	6 samples	GEO	https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/exd.14266
GSE62395 地理信息系统访问记录查看器 --- GEO Accession viewer	人 (Homo sapiens)	3D口腔黏膜模型（MatTek）	对照 vs 12Gy vs 2Gy照射	对照 / 2Gy / 12Gy 3组	单一时间点	Phalanx Human OneArray v5	—	GEO	25705238 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25705238 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26697327
GSE62397 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE62397	人 (Homo sapiens)	3D人口腔角质形成细胞	对照 vs 12Gy vs NAC预处理 vs QYD预处理 vs 联合干预	5组（对照、照射、NAC、QYD、联合）	照射后	Phalanx Human OneArray v5	15 samples（5组×3重复）	GEO	25705238, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25705238 26697327 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26697327
GSE83349 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE83349	大鼠 (Rattus norvegicus)	三叉神经节	醋酸诱导口腔溃疡性黏膜炎模型	病例组 vs 对照组	—	Affymetrix Rat Genome 230 2.0	—	GEO	https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/37079608

优势备注：

• GSE103412：真实患者临床样本，时间序列最完整，含健康对照
• GSE150738 / GSE62397：含药物干预，适用药效评估
• GSE62395：剂量梯度比较，与GSE62397互为补充
• GSE83349：大鼠模型，醋酸诱导（非放疗），病理与RIOM重叠，可作间接参照

三、多组学关联数据

研究类型	样本量	数据类型	关键发现	获取方式
GWAS全基因组	1,467例鼻咽癌患者（753例2D-CRT + 714例IMRT）	遗传易感位点分析	50个相关基因位点，64个基因；JNK、p38-MAPK信号通路富集	PMID: 32503578 https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/32503578/ https://link.springer.com/article/10.1186/s12967-020-02390-0 - 与 RIOM 的关系： - 核心问题：为什么同样放疗，有些患者发生严重黏膜炎，有些却很轻？GWAS 揭示的是遗传因素——某些患者天生携带易感基因变异，照射后更容易发生 RIOM - 发现 50 个相关基因位点，JNK / p38-MAPK 信号通路显著富集——与组织损伤、炎症调控直接相关 - 未来可做 eQTL 整合分析——将易感位点叠加到 scRNA-seq 数据中，看哪些细胞类型/基因表达受这些位点调控，从而解释个体差异。
蛋白质组	初代人角质形成细胞	质谱(MS)	干扰素反应、DNA修复通路激活；STAT1/ISG15上调	PMID: PMC10298177 文章：10.3389/fonc.2023.1180642 数据库：https://www.ebi.ac.uk/pride/archive/projects/PXD040398 https://proteomecentral.proteomexchange.org/?pxid=PXD040398